آموزش کار با Benchling در کلونینگ مولکولی
به دنیای حرفهای طراحی و مدیریت پروژههای کلونینگ مولکولی با پلتفرم Benchling خوش آمدید!
در این دوره تخصصی، شما با کاربردهای عملی Benchling در زیستشناسی مولکولی آشنا میشوید و میآموزید چگونه از این ابزار قدرتمند برای طراحی، تحلیل، و مستندسازی کل فرآیند کلونینگ استفاده کنید.
از ساخت و مدیریت پروژههای تحقیقاتی گرفته تا طراحی پرایمر، آنالیز پلاسمیدها، شبیهسازی مراحل برش آنزیمی، لیگیشن، و بررسی توالی ها، همه در محیطی یکپارچه و مبتنی بر فضای ابری آموزش داده میشود. در این دوره، یاد میگیرید چگونه دادهها، توالیها و مراحل اجرایی را بهصورت دقیق مستندسازی کرده و با دیگران بهصورت تیمی همکاری کنید. این دوره برای پژوهشگران، دانشجویان، و فعالان حوزه زیستشناسی مولکولی طراحی شده است که میخواهند مهارت استفاده از Benchling را در کلونینگهای واقعی کسب کنند و اجرای پروژههای خود را سریعتر، دقیقتر و حرفهایتر انجام دهند. با پایان این دوره، شما قادر خواهید بود تا پروژههای کلونینگ را از طراحی درونسازمانی تا اجرای دقیق و مستند، بهطور کامل در Benchling مدیریت کنید.
توضیحات
Benchling چیست؟
Benchling یک پلتفرم بیوانفورماتیکی مبتنی بر فضای ابری (cloud-based) است که برای طراحی، مستندسازی، و مدیریت پروژههای زیستمولکولی توسعه یافته است. این ابزار توسط پژوهشگران علوم زیستی، از جمله زیستشناسان مولکولی، بیوانفورماتیسینها، و تیمهای تحقیق و توسعه در شرکتها و دانشگاهها مورد استفاده قرار میگیرد.
Benchling محیطی یکپارچه و کاربرپسند فراهم میکند که در آن میتوان توالیهای DNA، RNA، و پروتئین را طراحی، آنالیز، حاشیهنویسی و مدیریت کرد. همچنین امکاناتی برای برنامهریزی آزمایشها، پیگیری پیشرفت پروژه، مستندسازی دقیق مراحل کاری، و اشتراکگذاری دادهها با سایر اعضای تیم دارد.
کاربرد Benchling در کلونینگ مولکولی
در دنیاری کلونینگ مولکولی، Benchling یک ابزار بسیار کارآمد و دقیق برای انجام مراحل مختلف طراحی و تحلیل پروژههای کلونینگ است. کاربردهای کلیدی آن:
1. طراحی و آنالیز توالیها: وارد کردن و ویرایش توالیهای DNA، آنالیز ویژگیهای توالی (مانند ORFها، نواحی پروموتر، مارکرها و …)، یافتن و جایگذاری مکانهای برش آنزیمی
2. شبیهسازی مراحل کلونینگ: طراحی استراتژی برش آنزیمی با انتخاب آنزیمهای مناسب، شبیهسازی لیگیشن بین قطعات DNA و پلاسمید، بررسی نتایج کلونینگ قبل از انجام عملی آن در آزمایشگاه
3. طراحی پرایمر: طراحی پرایمرهای PCR با پارامترهای دلخواه، مشاهده محل اتصال پرایمرها روی توالی، مدیریت پرایمرها در پروژههای مختلف
4. مدیریت پروژه و مستندسازی: ثبت مراحل انجامشده در قالب «Lab Notebook»، پیگیری نتایج آزمایشها و مدیریت نسخههای مختلف از یک توالی، همکاری تیمی و به اشتراکگذاری دادهها با دیگر اعضای پروژه
5. مدیریت بانک پلاسمیدها و ترکیبات دیگر: ایجاد بانک اطلاعاتی از پلاسمیدهای استفادهشده، ردیابی نمونهها و ترکیبات مورد استفاده در آزمایشها
مدرسان دوره
دکتر وحید نوه
دکتر وحید نوه (PhD). پژوهشگر و مدرس زیستشناسی مولکولی، بیوشیمی، فیزیولوژی و بیوانفورماتیک. رتبهبرتر کنکور ارشد و دکتری. استاد تمام دانشگاه تهران. بیش از ۱۴ سال سابقه تدریس و راهنمایی بیش از ۶۰ پایاننامه. سابقه پژوهش و آموزش در University of Durham انگلستان و McMaster University کانادا. تجربه صنعتی بهعنوان ساینتیست و مدلساز در کانادا. متخصص زیستشناسی مولکولی، سمشناسی، تحلیل آماری پیشرفته و برنامهنویسی. نویسنده، داور و دبیر تخصصی مقالات علمی بینالمللی. پیونددهنده دانش نظری و کاربردهای عملی.
