ورود / ثبت نام
برنامه‌نویسی کاربردی با R و آنالیز داده‌های بیولوژیک
R یک زبان برنامه‌نویسی و محیط آماری است که برای تحلیل داده‌ها و ایجاد گرافیک‌های آماری استفاده می‌شود. این زبان ابتدا توسط Ross Ihaka و Robert Gentleman در سال 1993 توسعه داده شد. R یک زبان متن‌باز است و دارای کتابخانه‌ها و پکیج‌های فراوانی برای تحلیل داده‌ها و ایجاد نمودارها است. با استفاده از R، می‌توانید تحلیل‌های آماری پیچیده را انجام داده و نتایج را به صورت گرافیکی نمایش دهید. بیولوژیست‌ها می‌توانند از قدرت R در تحلیل داده‌های بیولوژیکی و ایجاد نمودارهای مرتبط با آنها بهره ببرند.
برنامه نویسی با R برای بیولوژیست‌ها توانایی‌ها و ویژگی‌های منحصر به فردی دارد که آنها را در تحلیل داده‌های بیولوژیکی قدرتمند می‌سازد. در ادامه، به برخی از این توانایی‌ها و ویژگی‌ها اشاره خواهیم کرد:
R یکی از پرکاربردترین زبان‌های برنامه‌نویسی در حوزه علوم زیستی است. بیولوژیست‌ها می‌توانند از R برای تجزیه و تحلیل داده‌های بیولوژیکی مختلف مانند ژنومیک، پروتئومیک، متابولومیک، RNA-Seq و غیره استفاده کنند.
R دارای مجموعه بزرگی از کتابخانه‌ها و پکیج‌های مربوط به بیولوژی است که توسط جامعه‌ی R توسعه داده شده‌اند. این کتابخانه‌ها شامل ابزارها و توابع مختلفی برای تجزیه و تحلیل داده‌های بیولوژیکی، ترسیم نمودارها، مدل‌سازی آماری و غیره می‌شوند. این امکان را به بیولوژیست‌ها می‌دهد که با استفاده از ابزارهای قدرتمند R، به سرعت و به طور موثر در تحلیل داده‌های بیولوژیکی پیشرفته عمل کنند.
R یک زبان آماری قوی است و دارای توابع و ابزارهای آماری متنوعی است. این ویژگی به بیولوژیست‌ها امکان می‌دهد تا با استفاده از تکنیک‌های آماری پیشرفته، تجزیه و تحلیل دقیق‌تر و نتایج قابل اعتمادتری را ارائه کنند. بیولوژیست‌ها می‌توانند از آزمون‌های آماری، روش‌های ترسیم نمودارهای توصیفی و تحلیل آماری داده‌های بیولوژیکی در R بهره‌برداری کنند.
R یک زبان برنامه‌نویسی اسکریپتی است که به بیولوژیست‌ها امکان می‌دهد کدهای خود را به راحتی بنویسند و اجرا کنند. آنها می‌توانند توابع و بسته‌های خود را بسازند و قابلیت‌های جدید را به زبان اضافه کنند. این قابلیت به بیولوژیست‌ها امکان می‌دهد تا راه حل‌های سفارشی و تخصصی برای مسائل خاص بیولوژیکی خود پیاده‌سازی کنند.
R یک زبان برنامه‌نویسی متن‌باز است و دارای یک جامعه فعال از توسعه‌دهندگان است. این به معنای وجود منابع آموزشی غنی، ابزارها و راهنماهای مفید برای بیولوژیست‌ها است. اگر به مشکلی برخورد کنید یا نیاز به راهنمایی داشته باشید، می‌توانید به جامعه R مراجعه کنید و از تجربیات و دانش دیگران استفاده کنید.
در علوم زیستی، معمولاً با داده‌های بزرگ و پیچیده سروکار داریم. R با امکانات قدرتمند خود، امکان پردازش و تحلیل داده‌های بزرگ را فراهم می‌کند. از پیش‌پردازش داده‌ها تا استخراج اطلاعات مفید و ارائه نتایج، R می‌تواند برای بیولوژیست‌ها در مدیریت و تحلیل داده‌های بزرگ بسیار مفید باشد.
R دارای کتابخانه‌های قدرتمندی برای ترسیم نمودارها و تصویرسازی داده‌ها است. این قابلیت به بیولوژیست‌ها کمک می‌کند تا نتایج خود را به صورت بصری جذاب و قابل فهم به نمایش بگذارند. از نمودارهای مختلف مانند نمودارهای لینکاژی، نمودارهای توزیع، نمودارهای شبکه و غیره می‌توان برای نمایش داده‌های بیولوژیکی استفاده کرد.
R به بیولوژیست‌ها امکان می‌دهد تا با استفاده از کتابخانه‌ها و پکیج‌های مربوط به بیولوژی، به پایگاه‌داده‌های بیولوژیکی دسترسی داشته باشند. این پایگاه‌داده‌ها شامل اطلاعات ژنتیکی، توالی‌های DNA و RNA، پروتئین‌ها، طیف‌های جزئی و غیره می‌شوند. با استفاده از R، بیولوژیست‌ها می‌توانند این داده‌ها را استخراج و تحلیل کنند و به راحتی با آنها کار کنند. این امکان به آنها می‌دهد تا در پژوهش‌های خود از منابع غنی داده‌های بیولوژیکی بهره‌برداری کنند و تحلیل‌های پیشرفته‌تری انجام دهند.
R امکان ارتباط با زبان‌ها و ابزارهای دیگر را نیز فراهم می‌کند. بیولوژیست‌ها می‌توانند با استفاده از پکیج‌های مختلف، ارتباط با زبان‌های مانند Python و … را برقرار کنند. این قابلیت به آنها امکان می‌دهد از امکانات و ویژگی‌های مختلف این زبان‌ها استفاده کنند و بهترین روش‌ها را در تحلیل داده‌های بیولوژیکی خود به‌کار ببرند.
در دوره آموزشی برنامه‌نویسی کاربردی با R و آنالیز داده‌های بیولوژیک تلاش بر این است تا شما را با مبانی برنامه‌نویسی با R آشنا کند و توانایی شما را در استفاده از R در حوزه بیولوژی افزایش دهد. R یک زبان برنامه‌نویسی قدرتمند و پرکاربرد در علوم زیستی است که امکانات گسترده‌ای در تحلیل داده‌های بیولوژیکی فراهم می‌کند. در این دوره، شما با مفاهیم برنامه‌نویسی و زبان R آشنا می‌شوید و نحوه استفاده از آن در حل مسائل بیولوژیکی را یاد می‌گیرید. این دوره شامل این ماژول‌ها است:
مقدمه‌ای بر R: در این ماژول، شما با مبانی برنامه‌نویسی R و محیط کاری R Studio آشنا می‌شوید. یاد خواهید گرفت که چگونه داده‌ها را وارد کرده و مدیریت کنید. همچنین شیوه بررسی داده‌ها، و نحوه استفاده از کتابخانه‌ها و پکیج‌های مربوط به بیولوژی را نیز فرا می‌گیرید.
تجزیه و تحلیل داده‌ها در R: در این ماژول، شما با روش‌های تجزیه و تحلیل داده‌های بیولوژیکی در R آشنا می‌شوید. این شامل تجزیه و تحلیل آماری داده‌ها، ترسیم نمودارها، انجام آزمون‌های آماری در R می‌شود.
برنامه نویسی پیشرفته با R: در این ماژول، شما با مفاهیم پیشرفته‌تر برنامه نویسی R برای بیولوژی آشنا می‌شوند. شما یاد خواهید گرفت که چگونه توابع و بسته‌های خود را ایجاد و استفاده کنید، نحوه نوشتن حلقه‌ها و توابع قابل بازگشت، و ایجاد گزارش‌های خروجی بیولوژیکی در R را نیز می‌آموزید.
برنامه‌نویسی برای تحلیل داده‌های بیولوژیکی: در این ماژول، شما با استفاده از مفاهیم و تکنیک‌های برنامه‌نویسی در R، به حل مسائل خاص بیولوژیکی می‌پردازید. مواردی همچون کار با داده‌های RNA-Seq.
پروژه های عملی: در این بخش، شما می‌توانید مهارت‌هایی که در طی دوره آموزشی آموخته‌اید را در یک پروژه عملی بیولوژیکی به کار ببندید. این پروژه می‌تواند شامل تحلیل داده‌های واقعی بیولوژیکی با استفاده از R و ارائه نتایج تفسیر‌پذیر باشد.
با آکادمی‌قاصدک، گام به گام رشد کنید و دانش تئوری و کاربردی خود را همزمان گسترش دهید.
این دوره به چه کسانی توصیه می‌شود؟
- این دوره آموزشی برای بیولوژیست‌ها با هر سطح دانش برنامه‌نویسی مناسب است، از افراد مبتدی تا حرفه‌ای. تکنیک‌های برنامه‌نویسی به گونه‌ای تدریس می‌شوند که شما با اصول برنامه‌نویسی آشنا شوید و در عین حال به مسائل بیولوژیکی خود بپردازید.
- همه علاقمندان از زمینه‌های مختلف علمی از جمله میکروبیولوژی، بیوشیمی، بیوتکنولوژی، ایمونولوژی، داروسازی، تکنولوژی زیست‌پزشکی، ژنتیک، زیست‌سلولی‌مولکولی، زیست‌گیاهی، زیست‌جانوری، پزشکی، کشاورزی، علوم زیستی و بیوانفورماتیک از دانشگاه، صنعت و سازمان‌های آموزشی و پژوهشی.
- پژوهشگرانی که که برای پیشبرد و انجام آزمایش‌ها و مطالعات خود نیاز به کسب دانش کاربردی در زمینه بیوانفورماتیک دارند.
- دانشجویان و علاقمندان به اپلای برای دانشگاه‌های خارج از کشور.
پس از پایان دوره، شما قادر خواهید بود:
- داده‌های بیولوژیکی را با استفاده از R تجزیه و تحلیل کنید و نتایج قابل فهم و تفسیری را ارائه دهید.
- برنامه‌هایی برای حل مسائل خاص بیولوژیکی بنویسید و از تکنیک‌های پیشرفته برنامه نویسی R استفاده کنند.
- پروژه‌های بیولوژیکی خود را با استفاده از R انجام دهید و نتایج آنها را به صورت گزارش‌های قابل فهم و تفسیر بیولوژیکی تولید کنید.
- به صورت مستقل در پروژه‌های بیولوژیکی مشارکت کنید و داده‌های بیولوژیکی را بهبود بخشید.
- با استفاده از تکنولوژی‌های پیشرفته در بیولوژی مانند RNA-Seq، بیوانفورماتیک و تحلیل توالی‌های ژنتیکی کار کنید.
15 ساعت آموزش مفید
یادگیری آنلاین و امکان مرور دوباره
دسترسی به منابع دوره
سرتیفیکیت انگلیسی تکمیل دوره
پرسش‌های متداول دانشجویان
در پایان این دوره، سرتیفیکت دیجیتال تکمیل موفقیت‌آمیز این دوره از گروه Nexintek کانادا برای شرکت کنندگان به صورت الکترونیک و به زبان انگلیسی صادر خواهد شد. این گواهی پس از صدور در سایت این گروه آموزشی در بخش Certificate قابل جستجو و بررسی تایید اصالت خواهد بود.
- پیش‌نیاز، علاقه و انگیزه شما به همراه دسترسی به سرعت مطلوب اینترنت.
- دانش پیش‌زمینه درباره داده های بیولوژیک و بیوانفورماتیک
دسترسی به ویدیوها دست کم یک سال هست. آکادمی قاصدک دسترسی را محدود نخواهد کرد و شما بیش از این مدت و شاید برای بیش از یک سال دسترسی به دوره داشته باشید. احتیاط ما برای شرایط بین المللی غیرقابل پیش بینی است.
aysanasefpoorپژوهشگر
سلام و خسته نباشید، ممنون از دوره بسیار خوبتون. من یک مشکلی با نصب پکیج دارم. برای نصب hexabin و patchwork ارور میده که با این ورژن در دسترس نیست. من آخرین ورژن R رو نصب کردم نمیدونم مشکل چی هست.
قاصدک(پشتیبان علمی)
درود بر شما
اگر همه موارد بر اساس دوره آموزشی پیشرفته باشه نباید مشکلی وجود داشته باشه. ما امتحان کردیم و هیچ مشکلی مشاهده نکردیم. در هر صورت موارد زیر پیشنهاد می شود:
1- بروزرسانی RStudio: اگر نسخه RStudio قدیمی باشه، ممکنه با نسخه‌های جدید R ناسازگار بشه. از این لینک RStudio رو به آخرین نسخه بروز کنید
2- بررسی نسخه R در RStudio: گاهی اوقات ممکنه RStudio به نسخه‌ای از R متصل باشه که با سیستم شما مطابقت نداره. از مسیر زیر نسخه R رو بررسی کنید:
در RStudio، از منوی Tools وارد Global Options شوید.
در بخشGeneral قسمت R version بررسی کنید که آیا آخرین نسخه R به درستی انتخاب شده یا نه. اگر نسخه اشتباهی انتخاب شده، می‌تونید مسیر صحیح R رو به صورت دستی وارد کنید.
3- نصب پکیج‌ها در RStudio: اطمینان حاصل کنید که RStudio در زمان نصب پکیج‌ها به اینترنت متصل باشه و از دستور زیر برای نصب استفاده کنید:
install.packages(“hexbin”)
install.packages(“patchwork”)
4- اگر همچنان مشکل دارید، نصب پکیج‌ها از GitHub رو امتحان کنید:
install.packages(“devtools”)
devtools::install_github(“thomasp85/patchwork”)
devtools::install_github(“thomasp85/hexbin”)
پروز باشید
Baharپژوهشگر
سلام وقتتون بخیر
من متاسفانه همون اول کار ب مشکل خوردم😂
وقتی که دستور رو توی قسمت ادیتور وارد میکنم بعدش run یا source رو میزنم استور اجرا نمیشه ارور میده
Error unexpected
Error in source
(active R studio ducument)
قاصدک(پشتیبان علمی)
درود بر شما
این ارور زمانی که رخ می‌دهد به این معناست که دستوری که وارد کرده‌اید، به شکلی نادرست یا ناقص نوشته شده و R در حال تلاش برای اجرای آن به خطا برمی‌خورد. این اتفاق معمولاً به خاطر وجود اشتباهاتی در نحوه‌ی نوشتن کدها پیش می‌آید، مثل:
1- پرانتز، کروشه یا علامت نقل قول ناقص: ممکن است یکی از پرنتزها یا علامت‌های نقل قول را نبسته باشید.
2- دستور ناقص: احتمال دارد دستوری که وارد کرده‌اید ناقص باشد یا بخش مهمی از آن نادیده گرفته شده باشد.
3- کاراکتر یا سینتکس غیرقابل تشخیص: گاهی وجود کاراکترهای نادرست مانند کاما یا نقطه‌ویرگول اضافی می‌تواند باعث این خطا شود.
برای شروع، بهتر است:
کد خود را به دقت بررسی کنید تا مطمئن شوید که سینتکس صحیح است.
اگر کد طولانی است، آن را به قسمت‌های کوچکتر تقسیم کرده و هر قسمت را جداگانه اجرا کنید تا دقیق‌تر ببینید که مشکل در کدام بخش است.
r.ghasemmi94
با سلام. ممنون میشم راهنمایی کنید برای آموزش از دوره R شروع کنیم یا بایو پایتان؟
قاصدک(پشتیبان علمی)
دزود بر شما
برای یک بیولوژیست امروزی، دانستن هر دو زبان برنامه نویسی لازم هست. یادگیری زبان برنامه نویسی همانند یادگیری موسیقی است. صبر، پشتکار و حوصله نیاز دارد. برای کارهای بیوانفورماتیک برنامه نویسی پایتون و بایوپایتون پیشنهاد می شود و برای ویژوالیزیشن و نمایش داده، کار با داده، آنالیز داده و … برنامه نویسی R پیشنهاد می شود.
zeinab.kabirkoohiپژوهشگر
سلام و وقت بخیر. من تمام جلسات رو مشاهده کردم و میتونم بگم این دوره بسیار عااالی و همه چی تمام است. جناب دکتر حسینی با طمانینه تدریس میکنند و تمام جزئیات تدریس میشه. مثال ها، موضوع را جا میندازن و تکرار موضوعات باعث میشه تو ذهن بمونه. مفاهیم اولیه آماری خیلی خوب تدریس شد. بعد از اتمام دوره شما میتونین کد بزنین و آنالیزهای تدریس شده را انجام بدین. طبعاً برای تسلط کامل نیاز به تکرار و تمرین روی داده های متفاوت هست تا مجبور به حل چالشهای متفاوت بشویم. سپاس فراوان از جناب دکتر حسینی و آکادمی قاصدک برای برگزاری دوره های باکیفیت
قاصدک(پشتیبان علمی)
درود بر شما
بسیار خرسندیم که دوره برای شما مفید بوده است. برای آماده سازی این دوره توسط مدرس ماه ها وقت صرف شده است.
negin.sh96پژوهشگر
با سلام و خسته نباشید، در مبحث جملات شرطی شامل if و if else من وقتی واسه اجرا source رو استفاده میکنم اجرا نمیشه ولی وقتی run رو میزنم اجرا میشه. چطوری میتونم این مشکل رو حل کنم؟
قاصدک(پشتیبان علمی)
درود بر شما
لطفا در تالار گفتمان برنامه نویسی R ارسال موضوع نمایید.
abdullahimina958پژوهشگر
با سلام و احترام مدت دسترسی به جلسات تا چند وقته؟ و اینکه آیا قابلیت دانلود جلسات وجود داره؟
قاصدک(پشتیبان علمی)
درود بر شما
محدودیتی وجود ندارد. امکان تماشای دوره ها وجود دارد.
roshan.nouri1382پژوهشگر
سلام برای دانلود پکیج جلسه اخر این ارور را میده باید چی کار کنم؟
package ‘DESeq2’ is not available for this version of R
قاصدک(پشتیبان علمی)
درود بر شما
این خطا به این معنی است که پکیج “DESeq2” برای نسخه فعلی R که شما استفاده میکنید، در دسترس نیست. این می‌تواند به دلیل این باشد که نسخه‌ی مورد نیاز این پکیج با نسخه فعلی R شما سازگار نیست یا پکیج مورد نظر در مخازن اصلی R برای نسخه شما در دسترس نیست.
برای رفع این مشکل، می‌توانید به روش‌های زیر اقدام کنید:
1- بررسی نسخه‌ی پکیج و R: ابتدا مطمئن شوید که نسخه‌ی R و نسخه‌ی مورد نیاز برای پکیج “DESeq2” با هم سازگار است. ممکن است نیاز باشد که نسخه‌ی جدیدتری از R را نصب کنید.
2- نصب از منبع دیگر: اگر پکیج “DESeq2” برای نسخه‌ی شما در مخازن اصلی R در دسترس نیست، می‌توانید آن را از منبع دیگری نصب کنید. برای این کار، می‌توانید از مخازن CRAN، Bioconductor یا GitHub استفاده کنید. به عنوان مثال، برای نصب از Bioconductor، می‌توانید از دستور زیر استفاده کنید:
if (!requireNamespace(“BiocManager”, quietly = TRUE))
install.packages(“BiocManager”)
BiocManager::install(“DESeq2”)
3- تغییر نسخه‌ی R: در صورتی که نصب از منابع دیگر همچنان به مشکل برخوردار باشد، ممکن است نیاز باشد که به نسخه‌ی دیگری از R که با پکیج مورد نظر سازگار است، بروزرسانی کنید.
با اجرای یکی از روش‌های فوق، مشکل شما باید حل شود.
مریم دهقانیان
سلام. من یک فایل رو لود کردم. برای اینکه مطمئن بشم فایل به درستی خونده میشه دستور زیر رو بهش دادم:
glimpse(read.csv2(“Données_Gaz_particules_400180_fumier-vache.csv”))
و پاسخ زیر رو گرفتم:
Rows: 27
Columns: 1
$ Traitement.Periode.Repetition.P1.P2.P3.P4 “Fumier_VacheL_B.Verticaux…
اما وقتی میخوام داده های بین ستون اول تا آخر رو با دستور زیر انتخاب کنم:
dat.par %%
dplyr::select(Traitement:P4)
پاسخ زیر را دریافت میکنم:
Error in `dplyr::select()`:
! Can’t select columns that don’t exist.
✖ Column `Traitement` doesn’t exist.
Run `rlang::last_trace()` to see where the error occurred.
در حالیکه مشاهده میکنید که Traitement در فایل وجود دارد. میشه لطفا علت این ارور رو بفرمایید؟
قاصدک(پشتیبان علمی)
در دستور dplyr::select(Traitement:P4) شما سعی کرده‌اید با استفاده از اپراتور : از ستون Traitement تا P4 را انتخاب کنید. اما این روش در اینجا جواب نمی‌دهد چرا که این روش مختص اعداد صحیح است و برای نام‌های ستون‌ها کار نمی‌کند.
برای انتخاب ستون‌ها بر اساس نام آنها در dplyr، باید از تابع select() به شکل زیر استفاده کنید:
قاصدک(پشتیبان علمی)
dat.par %>%
dplyr::select(“Traitement.Periode.Repetition.P1.P2.P3.P4”)
roshan.nouri1382پژوهشگر
سلام استاد
در r stadio من ggplot اصلا باز نمیشه با اینکه ایکون plot هست ولی اصلا کد را نمیخونه که نمودار را بیاره
قاصدک(پشتیبان علمی)
درود بر شما
لطفا کد و خطای هنگام اجرای کد را با ما در میان بگذارید. لطفا اطمینان داشته باشید که هنگام اجرا ggplot لود شده است.
roshan.nouri1382پژوهشگر
could not find function “ggplot”
این خطارا میده
از کجا مطمین بشم که لود میشه؟
قاصدک(پشتیبان علمی)
# Load the ggplot2 package
library(ggplot2)
abdullahimina958پژوهشگر
سلام من این دوره رو خریدم ولی اصلا نمی دونم لینکای دانلود کجا هستن میشه راهنمایی کنید
دکتر وحید حسینی(پشتیبان علمی)
درود بر شما
لطفا پس از واردشدن به اکانت خود به بخش دوره های من یا دوره های خریداری شده بروید. روی دوره مورد نظر کلیک نمایید. در بخش جلسات دوره به مشاهده ویدیوها دسترسی دارید.
نگار
سلام خسته نباشید
من الان میخوام بیوانفورماتیک رو شروع کنم ولی هیچ دانش برنامه نویسی ندارم از نظر شما اول باید اون دوره های مربوط به زبان R یا پایتون رو بگذرونیم بعد بیام این دوره جامع بیوانفورماتیک یا مستقیم بیام از همین دوره جامع بیوانفورماتیک رو ثبت نام کنم؟؟
قاصدک(پشتیبان علمی)
درود بر شما
دوره جامع بیوانفورماتیک نیازی به دانش برنامه نویسی ندارد.
پیروز باشید
قاصدک(پشتیبان علمی)
درود بر شما
برای استفاده از دوره جامع بیوانفورماتیک نیاز به دانش برنامه نویسی ندارید.
vahide.majidifarپژوهشگر
با سلام و احترام
واقعا از کیفیت دوره R و تدریس شیوای آقای دکتر لذت بردم. با اینکه حدود سه سال هست که یادگیری R رو به صورت خود خوان و با استفاده از آموزش های یوتیوب شروع کردم، به جرئت میتونم بگم که این دوره یکی از کامل ترین دوره های آموزشی این نرم افزار هست. یکی از نقاط قوت این دوره مثل سایر دوره های آکادمی قاصدک، پاسخ به چرایی استفاده از دستورهای مختلف است که به نوبه خود در یادگیری عمیق و مفهومی بسیار نقش داره.
یه پیشنهاد هم داشتم که اگه امکان داره دوره پیشرفته تر تجزیه های آماری با استفاده از نرم افزار R ، شامل مدل های مختلف رگرسیونی و کاربرد اون ها هم تدریس بشه. از اونجایی که در دنیا از مدل های رگرسیونی به طور گسترده ای استفاده میشه و متاسفانه اطلاعات ما در این زمینه محدوده، به نظرم دوره پیشرفته تر هم مثل این دوره میتونه گره گشای مشکلات خیلی از ما دانشجویان باشه.
قاصدک(پشتیبان علمی)
درود بر شما
از نظر لطف شما و ارایه پیشنهادها بسیار سپاسگزاریم. خرسندیم که این دوره تونسته گامی مفید در یادگیری زبان برنامه نویسی R باشه. ابراز خرسندی و رضایت شما از این دوره مشوق بزرگی در ارایه دوره های بعدی ماست.
پیروز باشید
Adel Poshtdarپژوهشگر
سلام وقتتون بخیر
دوره بسیار لذت بخشی بود، به جرات میتونم بگم با اینکه حدود 15 سال کار پژوهشی میکنم تا الان دوره ای به این خوبی ندیم. پرادختن به جزئیات که از ملزومات این نرم افزارهاست بدون نقص و کامل هست و از همه جذاب تر صبوری و بیان روان استاد بود.
پیشنهاد میدم در صورت امکان تجزیه های تکمیلی، مدل های رگرسیونی، نمودارها و جداول زیبای همبستگی در R که بسیار پرکاربرد هستند و همچنین PCA به مجموعه اضاف بشه و بسیار مشتاق هستم برای اپدیت های بعدی
سپاس از وقت ارزشمندی که گذاشتید و تیم خوبتون
قاصدک(پشتیبان علمی)
درود بر شما
از نظر لطف شما سپاسگزاریم. ابراز رضایت شما از این دوره مشوق بزرگی در ارایه دوره های بعدی ماست.
در مورد بخشهایی که فرمودید حتمن در برنامه های ارایه ما قرار می گیرند.
پیروز باشید
roshan.nouri1382پژوهشگر
سلام وقتتون بخیر..میخواستم ببینم اگر ما الان درخواست سرتیفیکیت دوره را بدیم باز میتونیم ویدیو ها را ببینیم یا دسترسی قطع میشه؟
قاصدک(پشتیبان علمی)
درود بر شما.
محدودیتی در دسترسی به ویدیوها به وجود نمی آید.
پیروز باشید
Mona Sayahپژوهشگر
سلام باتشکر ازتیم خوب قاصدک، من توجلسه ی نوزدهم نتونستم از serverی که آقای دکتر فرمودن ، با دستورات زیر دیتا رو دانلود کنم. حتی توی صفحه ی اصلی وب هم در دسترس نیست این server.
download.file(url = “http://ndownloader.figshare.com/files/2292169”
destfile = “sample_data.csv”)
sample_data <- read_csv("http://ndownloader.figshare.com/files/2292169"😉
اروری هم که میده در زیر مینویسم:
Error in download.file(url = "http://ndownloader.figshare.com/files/2292169", :
cannot open URL 'http://ndownloader.figshare.com/files/2292169'
ممنون میشم راهنمایی کنید
دکتر وحید حسینی(پشتیبان علمی)
درود بر شما
دو خطا در کدی که نوشتید وجود دارد. یکی اینکه https باید باشد نه http. دیگر اینکه بین دو آرگیومنت باید کاما باشد. لطفا فایل کدهای مربوط به هر بخش را نیز دانلود نمایید و با کد خودتان مقایسه نمایید.
download.file(url = “https://ndownloader.figshare.com/files/2292169”,
destfile = “sample_data.csv”)
پیروز باشید
Mona Sayahپژوهشگر
متشکرم از راهنمایی تون. تصحیح کردم
شقایق شیرانیپژوهشگر
سلام، من دوره ی بیوانفورماتیک رو قبلا دیدم و واقعا خوب بود ولی برای این دوره که هنوز همه ی فصل های نیومده کاشکی مینوشتید که سرفصل ها چی هستند و یا یکم راجع به کسی که بهمون اموزش میده میگفتید بهمون.
باز هم ممنون بابت دوره های خیلی خوبتون
قاصدک(پشتیبان علمی)
درود در اینستاگرام آکادمی بخش هایلایت‌ها را مشاهده بفرمایید.
استاد این درس از طراحان اصلی دوره بیوانفورماتیک و مدلینگ پروتیین می‌باشند.
قدردان همراهی شما
شقایق شیرانیپژوهشگر
خیلی ممنون.
elham.ahmadzade1377پژوهشگر
سلام وقتتون بخیر، ممنون از تیم قاصدک
ببخشید من وقتی پکیج tidyverse رو لود میکنم این پیام برام می یاد
── Attaching core tidyverse packages ──────────────────────────────────────────────── tidyverse 2.0.0 ──
✔ dplyr 1.1.3 ✔ readr 2.1.4
✔ forcats 1.0.0 ✔ stringr 1.5.0
✔ ggplot2 3.4.2 ✔ tibble 3.2.1
✔ lubridate 1.9.2 ✔ tidyr 1.3.0
✔ purrr 1.0.2
── Conflicts ────────────────────────────────────────────────────────────────── tidyverse_conflicts() ──
✖ dplyr::filter() masks stats::filter()
✖ dplyr::lag() masks stats::lag()
ℹ Use the conflicted package to force all conflicts to become errors
باید چی کار کنم ارورش درست بشه؟
(من دو تا ورژن R رو نصب دارم یکی 4.1.1 و یکی هم 4.2.3 و این ارور رو روی ورژن 4.2.3 نشون میده)
قاصدک(پشتیبان علمی)
درود بر شما
ما خطایی نمی بینیم. این پیغام لود شدن این پکیج هست. اگر منطور شما conflict هست، این خطا نیست مثلن dplyr::filter() masks stats::filter() ، این پیام داره میگه که اگر بخواهید مثلن از تابع filter استفاده کنید، این تابع در دو پکیح وجود داره و اگر بخواهید از پکیج حاصی استفاده کنیدباید با استفاده از :: پکیج رو مشخص کنید.
elham.ahmadzade1377پژوهشگر
خیلی ممنون
aldis7596پژوهشگر
با عرض سلام و خسته نباشید
وقتی در Data frame,میخواهیم attach کنیم ارور زیر رو میده.
مشکل از کجاست ؟
:The following objects are masked _by_ .GlobalEnv
قاصدک(پشتیبان علمی)
درود بر شما
لطفا کد را ارسال نمایید.
aldis7596پژوهشگر
البته الان دوباره چک کردم اوکی شد
شاید به خاطر هیستوری بود که وقتی پاک کردم مشکلی نداشت
فاطمه دهقان شهرضاپژوهشگر
سلام و وقت بخیر.من دوره را ثبت نام کردم اما جلسه ابتدایی در پورتالم بارگذاری نشده است
قاصدک(پشتیبان علمی)
درود بر شما
شما از قسمت جلسات دوره ها به ویدیوهای بارگذاری شده دسترسی دارید. لطفا بفرمایید منظور از جلسه ابتدایی چیست؟ اگر از قسمت تماس با ما با ایمیل ارسال نمایید، ممنون خواهیم شد.
نسیم فتحی زادهپژوهشگر
با سلام.
من برای سیو scipt با پیغام فایل یافت نشد مواجهه شدم. و فایل در working directory ذخیره نمیشه
قاصدک(پشتیبان علمی)
درود بر شما
احتمالن WD را انتخاب نمودید ولی اون رو set نکردید. در دوره شیوه اینکار گفته شده است. لطفا مجددا مشاهده نمایید.
nazannghaderi24پژوهشگر
سلام و وقت بخیر خدمت تیم قاصدک
اول یه تشکر ویژه بابت این دوره ارزشمند ازتون دارم.
من دیروز مباحث پایه این دوره رو به اتمام رسوندم و بی صبرانه منتظرم تا ادامه این دوره رو لود کنید.
زکیه حیدریپژوهشگر
سلام وقت بخیر . من گزینه source رو میزنم این ارور رو میده
راهنمایی میفرمایید چطوری حلش کنم؟
Error in file(con, “w”) : cannot open the connection
In addition: Warning message:
In file(con, “w”) :
cannot open file ‘C:/Users/Avin/Documents/.active-rstudio-document’: No such file or directory
قاصدک(پشتیبان علمی)
درود بر شما
در زیر چند مرحله برای رفع این مشکل آورده شده است:
1. **بررسی مسیر فایل‌ها**: مطمئن شوید که اسکریپت R یا سند شما را در مکانی که وجود دارد و دسترس‌پذیر است ذخیره کرده‌اید. از صحت مسیرهای فایل در کد R خود مطمئن شوید.
2. **مجوزهای فایل**: مطمئن شوید که دسترسی‌های لازم برای نوشتن در دایرکتوری مشخص‌شده دارید. اگر سعی دارید خروجی یا نمودارها را ذخیره کنید، مطمئن شوید که دایرکتوری قابل نوشتن است.
3. **پاک کردن جلسه RStudio**: گاهی اوقات، وضعیت جلسه RStudio ممکن است مختل شود. می‌توانید RStudio را ببندید و دوباره باز کنید تا ببینید آیا مشکل رفع می‌شود یا خیر.
4. **راه‌اندازی مجدد R**: اگر راه‌اندازی مجدد RStudio به کمک نیامده‌است، می‌توانید خود جلسه R را با استفاده از منوی “Session” در RStudio و انتخاب “Restart R” راه‌اندازی مجدد کنید.
5. **بررسی دایرکتوری کاری**: با اجرای دستور `getwd()` در کنسول R، مسیر کاری کنونی را تأیید کنید. مطمئن شوید که به دایرکتوری معتبری که دسترسی نوشتن دارید تنظیم شده‌اید. می‌توانید با استفاده از `setwd()` مسیر کاری را تغییر دهید.
6. **نصب مجدد R و RStudio**: اگر هیچ‌کدام از مراحل فوق به شما کمک نکردند، می‌توانید تلاش کنید که R و RStudio را دوباره نصب کنید. گاهی اوقات، نصب تازه می‌تواند مشکلات غیرمنتظره را حل کند.